30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13198 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  811    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  50.76 
 
 
391 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  38.16 
 
 
393 aa  273  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  35.28 
 
 
414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 
396 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 
397 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 
425 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  37.18 
 
 
405 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  47.95 
 
 
429 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  29.1 
 
 
200 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 
195 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  32.26 
 
 
198 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  30.06 
 
 
200 aa  86.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2169  hypothetical protein  31.1 
 
 
186 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
210 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3109  hypothetical protein  27.44 
 
 
194 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.821183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  32.5 
 
 
236 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3898  hypothetical protein  27.11 
 
 
180 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  32.28 
 
 
210 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  33.33 
 
 
289 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  30 
 
 
225 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  27.27 
 
 
209 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 
192 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  31.37 
 
 
289 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
207 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  39.06 
 
 
152 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>