37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0827 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0827  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
228 aa  470  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0585865  unclonable  0.000000000612454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  87 
 
 
210 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1109  metal dependent phosphohydrolase  45.5 
 
 
195 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00168706  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1219  metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 
397 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99391  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  33.52 
 
 
393 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
397 aa  101  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2481  hypothetical protein  31.4 
 
 
405 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2813  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
414 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
396 aa  92.4  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.180277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05485  hypothetical protein  30.41 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1413  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
429 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.72811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2541  metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4928  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
391 aa  79  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2414  hypothetical protein  28.09 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00265902  normal  0.422792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13198  hypothetical protein  29.63 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.508394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  29.19 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3045  metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  29.27 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  30.85 
 
 
152 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1508  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  32.11 
 
 
217 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  26.17 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2828  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  30.3 
 
 
220 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  27.98 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  32.47 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  29.91 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3136  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  27.27 
 
 
446 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1357  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  30.84 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0901  metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
224 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  27.27 
 
 
228 aa  41.6  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>