57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1386 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  920    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  45.3 
 
 		 220 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  43.82 
 
 		 207 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  42.93 
 
 		 208 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  40 
 
 		 203 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  140  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  41.21 
 
 		 228 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  37.7 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  48.85 
 
 		 152 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  38.51 
 
 		 208 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  39.34 
 
 		 182 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  38.51 
 
 		 208 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  37.44 
 
 		 225 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  36.81 
 
 		 213 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  33.52 
 
 		 224 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 		 207 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  36.67 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  37.1 
 
 		 231 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  34.21 
 
 		 210 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  30.05 
 
 		 215 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  35.68 
 
 		 252 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  32.97 
 
 		 209 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  34.04 
 
 		 226 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  35.57 
 
 		 226 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  34.78 
 
 		 200 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  37.02 
 
 		 223 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  33.5 
 
 		 204 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  35.26 
 
 		 250 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  35.8 
 
 		 179 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  34.92 
 
 		 300 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  32.09 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  35.48 
 
 		 218 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  31.38 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  32.04 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  33.92 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  34.55 
 
 		 202 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  33.52 
 
 		 208 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  32.95 
 
 		 312 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  34.02 
 
 		 228 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  30.23 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  29.44 
 
 		 289 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  30.68 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  28.88 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  31.72 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  33.81 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  35.23 
 
 		 310 aa  66.6  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  28.12 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  28.07 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  28.19 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  26.74 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  29.9 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  27.41 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  31.12 
 
 		 389 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4476  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 210 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.77573  decreased coverage  0.000567143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4472  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 		 200 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>