56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5615 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  357  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  96.65 
 
 		 179 aa  346  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  80.23 
 
 		 225 aa  291  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  57.3 
 
 		 204 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  38.95 
 
 		 203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  40.7 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  40.11 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  41.86 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  38.71 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  32.2 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  35.67 
 
 		 236 aa  95.9  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  36.36 
 
 		 446 aa  94.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  39.31 
 
 		 228 aa  89.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  36.93 
 
 		 209 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  28.09 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  33.93 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  27.78 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  34.34 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  31.49 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  38.86 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  33.87 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  31.03 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  33.7 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  32.75 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  30.56 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  34.64 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  35.75 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  33.14 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  31.36 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  31.82 
 
 		 280 aa  72  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  33.76 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  32.75 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  32.76 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  32.56 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  30.69 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  24.44 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  31.82 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  27.68 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  30.34 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  36.11 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  31.49 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  32.94 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  28.42 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6907  hypothetical protein  42.65 
 
 		 370 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0548239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  27.72 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  28.09 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  29.38 
 
 		 289 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  30.36 
 
 		 310 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  25.95 
 
 		 280 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  25.79 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0822  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 397 aa  44.3  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3753  hypothetical protein  25.93 
 
 		 393 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  26.42 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0935  metal dependent phosphohydrolase  29.75 
 
 		 396 aa  41.6  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.180277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>