54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1342 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  93.15 
 
 		 226 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  43.72 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  44.83 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  32.85 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  43.96 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  43.85 
 
 		 182 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  32.87 
 
 		 209 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  36.76 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  31.55 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  38.57 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  33.81 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  39.15 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  34.04 
 
 		 446 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  28.93 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  47.52 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  31.98 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  39.36 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  33.68 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  33.8 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  39.15 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  39.01 
 
 		 152 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  36.94 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  36.15 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  34.48 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  32.87 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  37.84 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  35.71 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  37.69 
 
 		 315 aa  86.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  40.47 
 
 		 207 aa  85.5  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  35.35 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  37.36 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  39.81 
 
 		 310 aa  81.6  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  38.54 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  37.17 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  40.66 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  32.8 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  37.14 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  37.24 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  38.42 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  36 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  35.75 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  42.18 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  31.38 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  34.39 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  32.47 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  35.48 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  33.52 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  39.11 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  29.91 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  26.41 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  29.11 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  31.63 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6907  hypothetical protein  34.07 
 
 		 370 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0548239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>