60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5830 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  791    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  70.21 
 
 		 280 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  30.86 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  31.12 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  34.68 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  33.16 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  31.25 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  29.65 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  28.82 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  32.62 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  32.68 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  32.98 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  28.1 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  33.17 
 
 		 230 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  29.52 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  27.06 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  31.11 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  28.02 
 
 		 207 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  34.83 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  42.42 
 
 		 77 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2478  protein of unknown function DUF1653  40.3 
 
 		 80 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  30.46 
 
 		 201 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2896  hypothetical protein  46.03 
 
 		 76 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  30.68 
 
 		 179 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2785  protein of unknown function DUF1653  40.3 
 
 		 77 aa  50.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  43.28 
 
 		 160 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1474  PKD  35.37 
 
 		 93 aa  49.7  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  28.71 
 
 		 231 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1582  hypothetical protein  43.08 
 
 		 80 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0262  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  34.81 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25100  hypothetical protein  41.18 
 
 		 124 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2147  hypothetical protein  41.18 
 
 		 124 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3807  hypothetical protein  38.67 
 
 		 78 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  30.11 
 
 		 179 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1277  protein of unknown function DUF1653  38.89 
 
 		 78 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  24.86 
 
 		 236 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  25.71 
 
 		 206 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0461  hypothetical protein  41.38 
 
 		 77 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  31.63 
 
 		 209 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  31.46 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2727  protein of unknown function DUF1653  38.98 
 
 		 85 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3389  hypothetical protein  38.98 
 
 		 85 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00120  Protein of unknown function (DUF1653)  41.82 
 
 		 79 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  29.58 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  37.93 
 
 		 81 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3298  hypothetical protein  36.21 
 
 		 73 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.799272  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  33.87 
 
 		 289 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  32.22 
 
 		 208 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3515  hypothetical protein  39.39 
 
 		 87 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1303  hypothetical protein  37.84 
 
 		 82 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  34.96 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14460  hypothetical protein  39.68 
 
 		 78 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.690705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  37.17 
 
 		 250 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1072  hypothetical protein  40.98 
 
 		 72 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944533  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2232  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1170  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.453785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>