130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1611 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  318  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2268  hypothetical protein  66.18 
 
 		 75 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1582  hypothetical protein  65.33 
 
 		 80 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  73.85 
 
 		 76 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3515  hypothetical protein  68.75 
 
 		 87 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3877  TonB box-like  68.75 
 
 		 78 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121444  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14460  hypothetical protein  61.84 
 
 		 78 aa  97.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.690705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  69.84 
 
 		 77 aa  97.1  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2498  protein of unknown function DUF1653  63.89 
 
 		 76 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1719  protein of unknown function DUF1653  66.18 
 
 		 79 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000198179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3288  hypothetical protein  67.19 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.264781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0262  hypothetical protein  69.23 
 
 		 71 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1654  hypothetical protein  67.19 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2138  hypothetical protein  67.19 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109451  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3604  hypothetical protein  67.19 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136682  normal  0.268086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  65.15 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2219  hypothetical protein  59.7 
 
 		 79 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.407706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2896  hypothetical protein  72.58 
 
 		 76 aa  94.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00120  Protein of unknown function (DUF1653)  63.16 
 
 		 79 aa  93.6  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1969  hypothetical protein  60.94 
 
 		 75 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25100  hypothetical protein  61.97 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2147  hypothetical protein  57.14 
 
 		 124 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0071  hypothetical protein  64.06 
 
 		 70 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.309822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1678  hypothetical protein  67.19 
 
 		 83 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1303  hypothetical protein  70.97 
 
 		 82 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0461  hypothetical protein  65.08 
 
 		 77 aa  87  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1474  PKD  64.18 
 
 		 93 aa  87  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3807  hypothetical protein  53.62 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5371  hypothetical protein  57.58 
 
 		 90 aa  85.1  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400948 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2478  protein of unknown function DUF1653  61.9 
 
 		 80 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3090  hypothetical protein  50.72 
 
 		 71 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1796  hypothetical protein  52.7 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  60 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3218  hypothetical protein  56.06 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3667  hypothetical protein  52.11 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3298  hypothetical protein  53.73 
 
 		 73 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.799272  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3389  hypothetical protein  60.66 
 
 		 85 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00754  hypothetical protein  59.68 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2727  protein of unknown function DUF1653  60.66 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0835  hypothetical protein  60.61 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1277  protein of unknown function DUF1653  57.38 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2785  protein of unknown function DUF1653  51.47 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  57.81 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1235  hypothetical protein  54.69 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.38 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2668  hypothetical protein  55 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1170  hypothetical protein  64.29 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.453785  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2232  hypothetical protein  64.29 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1755  hypothetical protein  66.67 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  66.67 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3046  hypothetical protein  57.69 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3731  hypothetical protein  64.81 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787713  normal  0.411943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1666  iron-sulfur cluster-binding protein  56.36 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127853  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2249  hypothetical protein  46.67 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.917639  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4240  hypothetical protein  65.31 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.532997  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4763  hypothetical protein  62.96 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1234  protein of unknown function DUF1653  56.06 
 
 		 68 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.787623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0846  hypothetical protein  61.82 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3491  hypothetical protein  61.82 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0176003  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4875  hypothetical protein  61.82 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5411  hypothetical protein  61.82 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4119  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.07 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1665  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.451989  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1401  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2516  hypothetical protein  60.47 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0574575  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3953  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616189  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  43.28 
 
 		 389 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0563  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.978670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  38.81 
 
 		 280 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1072  hypothetical protein  36.92 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944533  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5662  protein of unknown function DUF1653  38.1 
 
 		 64 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0394  protein of unknown function DUF1653  43.75 
 
 		 122 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.25684 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.94 
 
 		 296 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1482  hypothetical protein  44.07 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1440  protein of unknown function DUF1653  42.37 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1950  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  40.85 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.246705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.03 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  45 
 
 		 602 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1376  protein of unknown function DUF1653  41.27 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal  0.0947421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1838  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.1 
 
 		 671 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  41.67 
 
 		 808 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0137  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.86 
 
 		 127 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1378  hypothetical protein  43.55 
 
 		 90 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.66 
 
 		 652 aa  44.3  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.33 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0429552  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3429  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  34.21 
 
 		 572 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  32.89 
 
 		 572 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.6 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 		 597 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 		 632 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  39.39 
 
 		 610 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.94 
 
 		 373 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  37.5 
 
 		 322 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 		 619 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0307  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 251 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  40 
 
 		 334 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>