54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  92.79 
 
 
208 aa  362  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  39.22 
 
 
206 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  38.31 
 
 
203 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  44.85 
 
 
220 aa  138  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  40.74 
 
 
207 aa  128  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  45.32 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  45.5 
 
 
226 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  44.85 
 
 
225 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  42.33 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  41.71 
 
 
228 aa  118  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  40.4 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  41.09 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  38.2 
 
 
446 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  33 
 
 
236 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  38.61 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  34.76 
 
 
209 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  37.9 
 
 
315 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  36.27 
 
 
257 aa  104  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  36.04 
 
 
213 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  37.13 
 
 
204 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  41.33 
 
 
252 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  40.2 
 
 
223 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  42.25 
 
 
152 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  38.92 
 
 
289 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  39.23 
 
 
182 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  36.7 
 
 
300 aa  98.2  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  41.08 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  36.1 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  39.5 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  39.23 
 
 
201 aa  94.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  40.53 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  33.68 
 
 
232 aa  92.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  35.35 
 
 
289 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  33.85 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  29.89 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  35.5 
 
 
208 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  30.68 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  32.47 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  32.4 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  34.3 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  33.73 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  31.11 
 
 
280 aa  81.3  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  38.6 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  34.38 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  31.22 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  38.76 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  36.46 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  33.85 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4113  hypothetical protein  46.15 
 
 
66 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  32.99 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  35.91 
 
 
280 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  23.63 
 
 
257 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>