53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0173 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  51.5 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  46.07 
 
 
202 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  43.65 
 
 
209 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  30.5 
 
 
224 aa  98.6  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  32.68 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  36.36 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  36.76 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  36.41 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  29.85 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  35.24 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  40.98 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  38.07 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  33.87 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  37.17 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  30.1 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  33.85 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  34.78 
 
 
300 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  33.87 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  30.96 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  38.26 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  36.13 
 
 
226 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  33.84 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  34.52 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  34.57 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  32.79 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  38.89 
 
 
310 aa  68.6  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  27.23 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  32.22 
 
 
257 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  32.09 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  30.5 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  33.16 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  35.57 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  31.72 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  35.98 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  29.9 
 
 
446 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  36.32 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  37.42 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  32.82 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  32.45 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  37.66 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  29.38 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  33.52 
 
 
312 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  31.77 
 
 
217 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  32.49 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  34.34 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  27.84 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  26.9 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  34.01 
 
 
389 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  36.25 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  26.86 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>