71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26500 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  57.99 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  51.85 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  49.83 
 
 		 289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  53.85 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  51.1 
 
 		 315 aa  248  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  45.89 
 
 		 217 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  45.97 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  45.19 
 
 		 208 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  42.99 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  38.39 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3747  metal dependent phosphohydrolase  47.12 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0454823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  43.08 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0713  hypothetical protein  71.26 
 
 		 87 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.00000285629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31500  hypothetical protein  37.21 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0449001  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  42.62 
 
 		 209 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  38.05 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  43.28 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1249  hypothetical protein  67.47 
 
 		 93 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00737651  normal  0.251434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  32.39 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  38.1 
 
 		 208 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2810  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  38.89 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2939  hypothetical protein  36.87 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0769776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2053  hypothetical protein  36.87 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0993318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  28.93 
 
 		 203 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21710  hypothetical protein  63.22 
 
 		 195 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.177303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  37.24 
 
 		 220 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  38.39 
 
 		 223 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  37.29 
 
 		 208 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3623  hypothetical protein  61.45 
 
 		 183 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  62.34 
 
 		 97 aa  95.9  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  34.66 
 
 		 207 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3956  hypothetical protein  61.25 
 
 		 86 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  30.69 
 
 		 206 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  35.02 
 
 		 209 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8119  hypothetical protein  56.96 
 
 		 98 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  35.26 
 
 		 182 aa  92  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  34.13 
 
 		 213 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  28.42 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3943  hypothetical protein  60.98 
 
 		 101 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0121243  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  34.92 
 
 		 446 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0790  hypothetical protein  60.24 
 
 		 92 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  35.03 
 
 		 208 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  34.82 
 
 		 231 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1381  hypothetical protein  59.78 
 
 		 107 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07890  hypothetical protein  53.85 
 
 		 182 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0838  hypothetical protein  33 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.177649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0919  hypothetical protein  60 
 
 		 91 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0454147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  36.15 
 
 		 226 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  36.79 
 
 		 250 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0784  hypothetical protein  53.41 
 
 		 93 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  36.79 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  34.05 
 
 		 200 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  36.49 
 
 		 152 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  35.33 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  25.94 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  32.14 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43076  predicted protein  32.23 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  36.14 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  30.95 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  31.71 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  28.33 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1122  hypothetical protein  38.16 
 
 		 85 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  42.86 
 
 		 94 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6828  hypothetical protein  39.19 
 
 		 116 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6907  hypothetical protein  33.52 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0548239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  40.28 
 
 		 91 aa  45.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  39.74 
 
 		 100 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>