22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3943 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3943  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  201  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0121243  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0919  hypothetical protein  76.25 
 
 
91 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0454147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1381  hypothetical protein  79.45 
 
 
107 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0784  hypothetical protein  70.93 
 
 
93 aa  117  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8119  hypothetical protein  67.09 
 
 
98 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  70.51 
 
 
97 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3956  hypothetical protein  63.95 
 
 
86 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113603  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0713  hypothetical protein  62.2 
 
 
87 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.00000285629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0790  hypothetical protein  59.09 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1249  hypothetical protein  60 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00737651  normal  0.251434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  60.98 
 
 
300 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  58.54 
 
 
289 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  59.76 
 
 
315 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  58.54 
 
 
310 aa  87.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3623  hypothetical protein  52.87 
 
 
183 aa  85.5  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  52.44 
 
 
289 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07890  hypothetical protein  50 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21710  hypothetical protein  44.19 
 
 
195 aa  62.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.177303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  42.27 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4277  hypothetical protein  34.65 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>