27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3623 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3623  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  353  7.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1249  hypothetical protein  63.53 
 
 
93 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00737651  normal  0.251434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0713  hypothetical protein  63.53 
 
 
87 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.00000285629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0790  hypothetical protein  62.5 
 
 
92 aa  98.6  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8119  hypothetical protein  60.26 
 
 
98 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  61.45 
 
 
300 aa  96.3  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21710  hypothetical protein  46.32 
 
 
195 aa  94.7  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.177303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  57.32 
 
 
315 aa  90.9  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  50.55 
 
 
289 aa  87.8  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3956  hypothetical protein  55.17 
 
 
86 aa  87.8  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  55.13 
 
 
97 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  55.56 
 
 
310 aa  87  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3943  hypothetical protein  52.87 
 
 
101 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0121243  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  51.65 
 
 
289 aa  85.1  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0784  hypothetical protein  50.59 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1381  hypothetical protein  55.17 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  50.57 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0919  hypothetical protein  51.25 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0454147  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07890  hypothetical protein  48.15 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  52.86 
 
 
91 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  42.31 
 
 
100 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  46.74 
 
 
94 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1122  hypothetical protein  38.16 
 
 
85 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1942  hypothetical protein  32.63 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4277  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1722  hypothetical protein  36.59 
 
 
89 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0155  hypothetical protein  36.84 
 
 
109 aa  40.8  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123262  hitchhiker  0.0000255316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>