24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3956 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3956  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1249  hypothetical protein  71.08 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00737651  normal  0.251434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8119  hypothetical protein  68.35 
 
 		 98 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0713  hypothetical protein  63.29 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.00000285629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3943  hypothetical protein  63.95 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0121243  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  62.82 
 
 		 97 aa  100  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0790  hypothetical protein  62.65 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  61.25 
 
 		 310 aa  96.7  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  60.76 
 
 		 289 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  60.76 
 
 		 312 aa  94  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  61.25 
 
 		 300 aa  93.6  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  63.29 
 
 		 315 aa  93.6  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0919  hypothetical protein  66.67 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0454147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  55.17 
 
 		 289 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3623  hypothetical protein  55.17 
 
 		 183 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1381  hypothetical protein  61.97 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0784  hypothetical protein  55.29 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07890  hypothetical protein  46.84 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21710  hypothetical protein  46.91 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.177303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  42.86 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  38.16 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1122  hypothetical protein  32.43 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  42.25 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1942  hypothetical protein  32.43 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>