22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0784 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0784  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0919  hypothetical protein  73.75 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0454147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3943  hypothetical protein  70.93 
 
 
101 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0121243  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1381  hypothetical protein  70.59 
 
 
107 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  61.36 
 
 
310 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  62.82 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8119  hypothetical protein  59.49 
 
 
98 aa  93.6  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1249  hypothetical protein  55.56 
 
 
93 aa  91.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00737651  normal  0.251434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0713  hypothetical protein  55.68 
 
 
87 aa  88.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.00000285629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0790  hypothetical protein  56.98 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  53.41 
 
 
300 aa  83.6  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3956  hypothetical protein  55.29 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  52.27 
 
 
289 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  53.66 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3623  hypothetical protein  50.59 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  48.39 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21710  hypothetical protein  49.44 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.177303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07890  hypothetical protein  50 
 
 
182 aa  72  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  46.67 
 
 
312 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  45.83 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  39.29 
 
 
94 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>