24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0790 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0790  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  183  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1249  hypothetical protein  61.96 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00737651  normal  0.251434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0713  hypothetical protein  62.79 
 
 
87 aa  103  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.00000285629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8119  hypothetical protein  63.29 
 
 
98 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3956  hypothetical protein  62.65 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3623  hypothetical protein  62.5 
 
 
183 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3943  hypothetical protein  59.09 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0121243  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  52.87 
 
 
289 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  52.87 
 
 
289 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0919  hypothetical protein  62.96 
 
 
91 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0454147  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  60.24 
 
 
300 aa  90.1  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0784  hypothetical protein  56.98 
 
 
93 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  55.81 
 
 
310 aa  87.4  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  56.63 
 
 
315 aa  84.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1381  hypothetical protein  62.16 
 
 
107 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21710  hypothetical protein  50.55 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.177303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0691  hypothetical protein  52.22 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23308  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07890  hypothetical protein  46.43 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  48.24 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  47.22 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  43.04 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1122  hypothetical protein  35.9 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1942  hypothetical protein  29.87 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>