More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0406 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0406  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  42.52 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  40.16 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  41.01 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1806  ATPase  40.38 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  41.23 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  38.84 
 
 		 268 aa  161  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  40.57 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  44.72 
 
 		 248 aa  161  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  40 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0834  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  39.72 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  44 
 
 		 252 aa  159  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0831  ABC transporter related  40.76 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  37.5 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  44.72 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  41.63 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  40.6 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  40.6 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  40.6 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  41.31 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 240 aa  157  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  40.17 
 
 		 243 aa  157  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  38.57 
 
 		 241 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  38.05 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1165  ATPase  41.12 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  39.35 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  42.38 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  37.22 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  40.19 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  43.22 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4774  ABC transporter related  39.25 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  40.6 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2120  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.22 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  42.06 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4070  ABC transporter-related protein  40.28 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  38.94 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  42.38 
 
 		 250 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2492  ABC transporter related  42.79 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.32 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  39.73 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12101  ABC transporter for amino acids, ATP binding component  39.04 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5846  ABC transporter related  38.53 
 
 		 250 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  37.85 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  37.85 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4250  ABC transporter related  39.25 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  normal  0.0122802 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0655  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0688  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000562177  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  40.3 
 
 		 272 aa  155  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  41.12 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  41.43 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  40.18 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  42.71 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  41.12 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  37.85 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  38.12 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  40.38 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1211  ABC transporter-related protein  36.24 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  40.65 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  40.72 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  37.24 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  41.4 
 
 		 244 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 244 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  44.22 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  38.86 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2956  ABC transporter related  38.46 
 
 		 241 aa  154  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  41.12 
 
 		 247 aa  154  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  36.12 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.32 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  36.25 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  41.4 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  39.91 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  41.12 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>