More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0090 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0090  type III secretion system ATPase  100 
 
 		 434 aa  878    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  41.26 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  40.56 
 
 		 443 aa  318  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  40.87 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  42.55 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  40.87 
 
 		 427 aa  316  7e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  42.52 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  40.19 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  37.79 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  39.57 
 
 		 442 aa  294  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  38.94 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  37.67 
 
 		 474 aa  289  7e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  39.05 
 
 		 442 aa  289  7e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  40.19 
 
 		 463 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  40.19 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  37.64 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  37.64 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  38.57 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  40.42 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  40.59 
 
 		 443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  40.59 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  38.46 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  35.55 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  40.19 
 
 		 442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  36.54 
 
 		 437 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  40.59 
 
 		 449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  37.41 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  38.48 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  38.46 
 
 		 441 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  39.29 
 
 		 470 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  37.96 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  38.54 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  38.77 
 
 		 449 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  36.58 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  36.92 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  39.23 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  40.35 
 
 		 442 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  39.39 
 
 		 422 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  39.72 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  37.68 
 
 		 440 aa  279  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  38.35 
 
 		 435 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  38.67 
 
 		 552 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  39.71 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  39.51 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  38.33 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  37.5 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  39.71 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  38.86 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  39.71 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  37.8 
 
 		 463 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  37.7 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  39.71 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  40.35 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  37.01 
 
 		 442 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  40.15 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  40.15 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  40.15 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  38.72 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  39.9 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  39.9 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  38.44 
 
 		 549 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  41.04 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  38.39 
 
 		 547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  37.47 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  39.02 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  37.44 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  37.11 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  37.56 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  38.82 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  38.82 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  37.8 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  37.44 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  36.87 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  39.75 
 
 		 489 aa  272  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  38.37 
 
 		 439 aa  272  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  36.66 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  37.13 
 
 		 466 aa  272  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  39.52 
 
 		 524 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  41.11 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  37.85 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  37.99 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  37.85 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  37.85 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  37.85 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  37.85 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  37.29 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  41.11 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  35.96 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  40 
 
 		 445 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  37.27 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  38.79 
 
 		 514 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  38.79 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  37.62 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  38.79 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  37.94 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  37.76 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3403  flagellum-specific ATP synthase FliI  37.76 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  37.76 
 
 		 526 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  37.76 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  39.66 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>