61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11204 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11204  hypothetical protein  100 
 
 		 939 aa  1876    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2450  DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.77 
 
 		 952 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2171  type III restriction enzyme, res subunit  28.34 
 
 		 989 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0533781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3249  type III restriction protein res subunit  25.59 
 
 		 884 aa  181  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0575  hypothetical protein  24.16 
 
 		 895 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0502043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2405  type III restriction protein res subunit  27.81 
 
 		 930 aa  164  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752692  normal  0.0809494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  27.42 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  27.14 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  32.46 
 
 		 468 aa  55.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  27.19 
 
 		 579 aa  55.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  26.96 
 
 		 440 aa  54.7  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  27.62 
 
 		 590 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  29.55 
 
 		 590 aa  52.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  37.76 
 
 		 466 aa  52.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  28.81 
 
 		 590 aa  51.6  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  26.47 
 
 		 590 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  42.65 
 
 		 466 aa  50.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  33.68 
 
 		 451 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  22.53 
 
 		 585 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  27.24 
 
 		 479 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  26.43 
 
 		 580 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  28.52 
 
 		 444 aa  48.9  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 590 aa  48.9  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  26.32 
 
 		 583 aa  48.5  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  26.21 
 
 		 586 aa  48.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  28.46 
 
 		 602 aa  48.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  26.92 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  34.74 
 
 		 451 aa  47.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  26.92 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  26.92 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  25.95 
 
 		 494 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  26.92 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  26.92 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  26.92 
 
 		 586 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  33.68 
 
 		 451 aa  47.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 		 586 aa  47.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  27.23 
 
 		 597 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 499 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.33 
 
 		 558 aa  46.2  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 580 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  27.39 
 
 		 584 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  31.78 
 
 		 548 aa  45.8  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  32.29 
 
 		 558 aa  45.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.03 
 
 		 550 aa  45.8  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  25.55 
 
 		 580 aa  45.8  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  25.75 
 
 		 586 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  26.51 
 
 		 613 aa  45.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  27.87 
 
 		 584 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  25.75 
 
 		 586 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  25.75 
 
 		 586 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  25.75 
 
 		 586 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  25.75 
 
 		 586 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  29.93 
 
 		 456 aa  45.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  29.45 
 
 		 451 aa  45.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 584 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  32.32 
 
 		 558 aa  45.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  32.29 
 
 		 554 aa  45.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  27.81 
 
 		 469 aa  44.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  27.07 
 
 		 1137 aa  44.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 584 aa  44.3  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>