20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2171 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2171  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 989 aa  2041    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0533781  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11204  hypothetical protein  27.8 
 
 		 939 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2450  DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.81 
 
 		 952 aa  348  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0575  hypothetical protein  25.08 
 
 		 895 aa  246  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0502043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3249  type III restriction protein res subunit  25.23 
 
 		 884 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2405  type III restriction protein res subunit  24.49 
 
 		 930 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752692  normal  0.0809494 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  30.56 
 
 		 456 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  25.86 
 
 		 479 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  30.97 
 
 		 811 aa  47.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  22.86 
 
 		 479 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  29.27 
 
 		 440 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  28.12 
 
 		 590 aa  47  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  25.86 
 
 		 479 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  25.86 
 
 		 479 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  32.05 
 
 		 548 aa  45.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  21.3 
 
 		 444 aa  45.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 654 aa  45.4  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  24.29 
 
 		 488 aa  45.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  32.05 
 
 		 548 aa  45.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  27.43 
 
 		 443 aa  44.7  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>