29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0575 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 895 aa  1855    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0502043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3249  type III restriction protein res subunit  67.04 
 
 		 884 aa  1261    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2405  type III restriction protein res subunit  34.61 
 
 		 930 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752692  normal  0.0809494 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2171  type III restriction enzyme, res subunit  25.15 
 
 		 989 aa  248  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0533781  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11204  hypothetical protein  23.94 
 
 		 939 aa  154  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2450  DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.32 
 
 		 952 aa  144  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  28.91 
 
 		 485 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  29.61 
 
 		 479 aa  54.7  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0947  hypothetical protein  30.93 
 
 		 110 aa  54.7  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  28.22 
 
 		 485 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  29.61 
 
 		 479 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 		 479 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  29.95 
 
 		 479 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  22.83 
 
 		 551 aa  52.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.19 
 
 		 531 aa  50.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  23.61 
 
 		 654 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.29 
 
 		 444 aa  49.7  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 463 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 455 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  35.14 
 
 		 1061 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  35.14 
 
 		 1051 aa  47.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  30.51 
 
 		 982 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  33.71 
 
 		 1055 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  36 
 
 		 1052 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  35.06 
 
 		 1055 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  24.53 
 
 		 466 aa  45.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  35.06 
 
 		 1055 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  24.89 
 
 		 652 aa  45.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2673  type III restriction protein res subunit  40 
 
 		 665 aa  44.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>