23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2405 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2405  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 930 aa  1904    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752692  normal  0.0809494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0575  hypothetical protein  34.61 
 
 		 895 aa  532  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0502043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3249  type III restriction protein res subunit  35.52 
 
 		 884 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2171  type III restriction enzyme, res subunit  24.68 
 
 		 989 aa  204  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0533781  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11204  hypothetical protein  28.34 
 
 		 939 aa  158  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2450  DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.58 
 
 		 952 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0947  hypothetical protein  28.72 
 
 		 110 aa  51.6  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  26.89 
 
 		 444 aa  51.6  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  34.95 
 
 		 649 aa  50.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  26.47 
 
 		 650 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  31.13 
 
 		 778 aa  50.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  36 
 
 		 466 aa  48.9  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.23 
 
 		 451 aa  48.5  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.33 
 
 		 558 aa  48.5  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.25 
 
 		 654 aa  47.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.23 
 
 		 555 aa  47  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.5 
 
 		 550 aa  46.2  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  33.33 
 
 		 548 aa  46.2  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  25.35 
 
 		 451 aa  45.4  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  31.62 
 
 		 558 aa  45.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  24.12 
 
 		 531 aa  45.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  35.79 
 
 		 666 aa  44.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 466 aa  44.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>