More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0822 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0822  permease protein of oligopeptide ABC  100 
 
 
341 aa  654    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325509  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.74 
 
 
341 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.46 
 
 
341 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.4 
 
 
341 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.4 
 
 
341 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  58.94 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.12 
 
 
341 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11441  putative ABC transporter of oligopeptides  54.55 
 
 
339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.333035  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08851  putative ABC transporter, oligopeptides  56.89 
 
 
339 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0705  ABC-type oligopeptide transport system permease  51.03 
 
 
340 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.797816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15391  putative ABC transporter, oligopeptides  50.73 
 
 
367 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134058  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11541  putative ABC transporter, oligopeptides  50.29 
 
 
340 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11531  putative ABC transporter, oligopeptides  50 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1059  putative ABC transporter, oligopeptides  50 
 
 
340 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11391  putative ABC transporter, oligopeptides  46.92 
 
 
354 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1960  putative ABC transporter, oligopeptides  54.84 
 
 
339 aa  298  6e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.506364  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0701  putative ABC transporter, oligopeptides  55.13 
 
 
339 aa  288  8e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.304067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.32 
 
 
335 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.02 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.38 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 
340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.66 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 
363 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0299866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.77 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.111375  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
335 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
334 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  38.44 
 
 
339 aa  243  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
345 aa  242  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
334 aa  239  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  38.69 
 
 
336 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
336 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  42.86 
 
 
336 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  39.64 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
336 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
336 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
333 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  40.99 
 
 
336 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  42.09 
 
 
336 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.37 
 
 
336 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  39.94 
 
 
336 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  41.3 
 
 
336 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
336 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.05 
 
 
336 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  38.87 
 
 
336 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
335 aa  228  9e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.6 
 
 
336 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.03 
 
 
336 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 
336 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  40.71 
 
 
336 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.43 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  36.92 
 
 
351 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  45.35 
 
 
336 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  40.6 
 
 
336 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  40.6 
 
 
336 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  40.3 
 
 
336 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
336 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  40.9 
 
 
336 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  40.9 
 
 
336 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.1 
 
 
336 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  40.48 
 
 
336 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
334 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0212  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  42.6 
 
 
363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206086  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.58 
 
 
337 aa  220  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.538486  hitchhiker  0.000000050567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  38.21 
 
 
337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
347 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  37.5 
 
 
339 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
337 aa  217  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.992492  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  37.5 
 
 
339 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
334 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
334 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  36.39 
 
 
334 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.02 
 
 
335 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
339 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
335 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  37.43 
 
 
335 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
334 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
334 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  36.98 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.78 
 
 
341 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445478  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  39.05 
 
 
336 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 
336 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  39.05 
 
 
336 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
332 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
313 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  36.31 
 
 
339 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  35.99 
 
 
339 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  36.31 
 
 
339 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  35.99 
 
 
339 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1098  peptide ABC transporter, permease protein  36.88 
 
 
336 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
336 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
338 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
329 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>