More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1960 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1960  putative ABC transporter, oligopeptides  100 
 
 		 339 aa  650    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.506364  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11441  putative ABC transporter of oligopeptides  68.73 
 
 		 339 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.333035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08851  putative ABC transporter, oligopeptides  79.06 
 
 		 339 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0701  putative ABC transporter, oligopeptides  89.97 
 
 		 339 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.304067  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0705  ABC-type oligopeptide transport system permease  59.41 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.797816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15391  putative ABC transporter, oligopeptides  59.41 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11391  putative ABC transporter, oligopeptides  52.51 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1059  putative ABC transporter, oligopeptides  52.8 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11541  putative ABC transporter, oligopeptides  52.51 
 
 		 340 aa  362  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11531  putative ABC transporter, oligopeptides  52.35 
 
 		 340 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.2 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.96 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.44 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  48.68 
 
 		 341 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.78 
 
 		 341 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.78 
 
 		 341 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0822  permease protein of oligopeptide ABC  54.84 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 		 335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.76 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  41.01 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  41.01 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.66 
 
 		 336 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  38.29 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  40.69 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 		 336 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  40.06 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  40.38 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  38.55 
 
 		 336 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.38 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  40.66 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  40.96 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  40.96 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  40.66 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.76 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  39.16 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.86 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  39.94 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  39.16 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.53 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.111375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  37.95 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.34 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  43.31 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  38.29 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 		 334 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  40.06 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.62 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.992492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  39.75 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  38.86 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 313 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  35.74 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  37.62 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.03 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  34.31 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 		 347 aa  202  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  35.11 
 
 		 339 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  35.42 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  35.74 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 		 335 aa  199  7.999999999999999e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3887  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  35.13 
 
 		 355 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 		 363 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0299866  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.59 
 
 		 336 aa  198  9e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  35.74 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  35.42 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  35.42 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  35.42 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  35.42 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>