More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_11541 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_11541  putative ABC transporter, oligopeptides  100 
 
 
340 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11531  putative ABC transporter, oligopeptides  98.24 
 
 
340 aa  658    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1059  putative ABC transporter, oligopeptides  92.35 
 
 
340 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11391  putative ABC transporter, oligopeptides  77.65 
 
 
354 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11441  putative ABC transporter of oligopeptides  61.19 
 
 
339 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.333035  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0705  ABC-type oligopeptide transport system permease  58.93 
 
 
340 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.797816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15391  putative ABC transporter, oligopeptides  59.28 
 
 
367 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134058  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08851  putative ABC transporter, oligopeptides  55.88 
 
 
339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.17 
 
 
341 aa  338  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.29 
 
 
341 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.53 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.53 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.56 
 
 
341 aa  311  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1960  putative ABC transporter, oligopeptides  52.51 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.506364  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  48.98 
 
 
341 aa  306  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0701  putative ABC transporter, oligopeptides  52.24 
 
 
339 aa  292  5e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.304067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0822  permease protein of oligopeptide ABC  50.78 
 
 
341 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325509  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
335 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
335 aa  239  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
335 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
335 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  37.97 
 
 
336 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  37.43 
 
 
336 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
336 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  36.23 
 
 
336 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
340 aa  226  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
341 aa  226  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  36.08 
 
 
336 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  35.76 
 
 
336 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
334 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
334 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  33.63 
 
 
351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  34.13 
 
 
336 aa  222  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
333 aa  222  8e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  35.74 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.9 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.49 
 
 
336 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.39 
 
 
336 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
347 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  35.13 
 
 
336 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  34.81 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  33.83 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
336 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  36.71 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  36.71 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  35.33 
 
 
337 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
336 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
336 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  35.44 
 
 
339 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 
336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  36.71 
 
 
336 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.36 
 
 
360 aa  215  9e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.111375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  35.74 
 
 
339 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  34.48 
 
 
339 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  34.48 
 
 
339 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.76 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  35.42 
 
 
339 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  36.39 
 
 
336 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  35.11 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
334 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  35.76 
 
 
336 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  34.8 
 
 
339 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  34.8 
 
 
339 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  34.8 
 
 
339 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  34.8 
 
 
339 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  35.76 
 
 
336 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
335 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  34.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  34.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  34.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  34.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  34.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  34.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  34.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
363 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0299866  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  34.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  36.79 
 
 
335 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  33.04 
 
 
381 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
334 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 
333 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  35.74 
 
 
339 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
334 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  34.18 
 
 
334 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  35.42 
 
 
339 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  35.44 
 
 
336 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 
338 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 
338 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 
338 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 
338 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  35.13 
 
 
336 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.13 
 
 
336 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
334 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
334 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
335 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.53 
 
 
347 aa  204  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  37.96 
 
 
336 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  35.44 
 
 
335 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>