More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0701 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0701  putative ABC transporter, oligopeptides  100 
 
 		 339 aa  653    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.304067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1960  putative ABC transporter, oligopeptides  89.97 
 
 		 339 aa  491  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.506364  normal  0.251507 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08851  putative ABC transporter, oligopeptides  78.76 
 
 		 339 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11441  putative ABC transporter of oligopeptides  67.85 
 
 		 339 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.333035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0705  ABC-type oligopeptide transport system permease  59.41 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.797816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15391  putative ABC transporter, oligopeptides  59.12 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.72 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11391  putative ABC transporter, oligopeptides  53.73 
 
 		 354 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11541  putative ABC transporter, oligopeptides  52.24 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1059  putative ABC transporter, oligopeptides  52.54 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.67 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11531  putative ABC transporter, oligopeptides  51.76 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.2 
 
 		 341 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  49.85 
 
 		 341 aa  338  5.9999999999999996e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 		 341 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 		 341 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0822  permease protein of oligopeptide ABC  55.13 
 
 		 341 aa  278  8e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.21 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 		 340 aa  242  6e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  39.56 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.24 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  40 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.7 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  38.62 
 
 		 336 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.7 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  39.75 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  37.61 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  38.21 
 
 		 336 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  39.43 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  38.81 
 
 		 336 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.7 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  38.51 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  38.69 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 		 363 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  39.4 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.81 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  39.4 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  39.7 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  39.7 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.992492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  41.79 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.08 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  35.19 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  38.51 
 
 		 336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.57 
 
 		 360 aa  215  7e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.111375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  35.91 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  38.21 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.05 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.05 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  37.43 
 
 		 336 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  36.2 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0299866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  37.91 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  34.9 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  37.34 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  35.31 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.32 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  34.42 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.34 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  37.62 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1299  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.75 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  34.72 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  34.72 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  34.72 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  34.72 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  34.72 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  34.72 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  34.72 
 
 		 339 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>