More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1637 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
341 aa  663    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
335 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 
335 aa  270  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
335 aa  264  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
341 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.41 
 
 
341 aa  252  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.06 
 
 
360 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.111375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.82 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11441  putative ABC transporter of oligopeptides  40.76 
 
 
339 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.333035  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0705  ABC-type oligopeptide transport system permease  39.47 
 
 
340 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.797816  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15391  putative ABC transporter, oligopeptides  39.17 
 
 
367 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134058  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
334 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
341 aa  236  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
363 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136904 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.88 
 
 
335 aa  235  9e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
363 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0299866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
334 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
340 aa  229  6e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11541  putative ABC transporter, oligopeptides  36.98 
 
 
340 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11531  putative ABC transporter, oligopeptides  36.69 
 
 
340 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
341 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
341 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.36 
 
 
336 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 
347 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 
336 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11391  putative ABC transporter, oligopeptides  37.09 
 
 
354 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  38.36 
 
 
336 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  36.09 
 
 
339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  39 
 
 
339 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  39 
 
 
339 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.35 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  37.83 
 
 
339 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  38.42 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1059  putative ABC transporter, oligopeptides  36.09 
 
 
340 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  37.54 
 
 
339 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  37.54 
 
 
339 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  37.54 
 
 
339 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  37.54 
 
 
339 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
334 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  37.24 
 
 
339 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  37.24 
 
 
339 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  37.24 
 
 
339 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  37.24 
 
 
381 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  37.24 
 
 
339 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  37.24 
 
 
339 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  37.24 
 
 
339 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  37.24 
 
 
339 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  37.24 
 
 
339 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  36.66 
 
 
339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
334 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08851  putative ABC transporter, oligopeptides  40.71 
 
 
339 aa  215  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
334 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  36.95 
 
 
339 aa  215  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
332 aa  215  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  36.95 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  37.54 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
333 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  36.07 
 
 
339 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  38.55 
 
 
336 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  38.86 
 
 
336 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.57 
 
 
334 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  38.86 
 
 
336 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
335 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  38.86 
 
 
336 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  38.86 
 
 
336 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  36.66 
 
 
339 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.35 
 
 
336 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0251  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
339 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
347 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
345 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.48 
 
 
335 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
335 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
335 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.71 
 
 
337 aa  205  7e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  37.42 
 
 
336 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
312 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  35.6 
 
 
334 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
311 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  35.22 
 
 
335 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  38.55 
 
 
336 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5117  ABC transporter permease  37.95 
 
 
336 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
313 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  35.53 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0212  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  38.76 
 
 
363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
329 aa  200  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  36.28 
 
 
336 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  35.1 
 
 
306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
336 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  36.47 
 
 
336 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  35.1 
 
 
306 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
337 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.992492  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  35.1 
 
 
306 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  35.1 
 
 
306 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 
306 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  36.58 
 
 
336 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
336 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>