More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1496 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 337 aa  656    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.992492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.9 
 
 		 337 aa  518  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.538486  hitchhiker  0.000000050567 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.23 
 
 		 337 aa  500  1e-140  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.7 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.7 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.4 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0375099  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.71 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00282517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  43.88 
 
 		 341 aa  263  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.38 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.89 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.89 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0299866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.99 
 
 		 341 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  42.09 
 
 		 336 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  41.79 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.9 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  42.38 
 
 		 336 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  41.77 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 		 333 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  41.37 
 
 		 337 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0212  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  42.77 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  39.7 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.65 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.111375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  40 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.49 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  41.49 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  41.49 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  38.51 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 		 338 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 		 341 aa  229  7e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 		 338 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.36 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  40.36 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11441  putative ABC transporter of oligopeptides  41.14 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.333035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  40.48 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.21 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.9 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  36.72 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  40.6 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  38.21 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  38.21 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  38.21 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  38.21 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.61 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08851  putative ABC transporter, oligopeptides  41.49 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.72 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  38.46 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  38.46 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  38.46 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  38.46 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0840  alkaline phosphatase  39.1 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  38.58 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  37.01 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  35.52 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  38.46 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  37.57 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  37.57 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  35.82 
 
 		 335 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  37.57 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  38.76 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  37.57 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  37.57 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  37.57 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  37.57 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  37.57 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  37.87 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  37.87 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  37.57 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  37.76 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  37.57 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0705  ABC-type oligopeptide transport system permease  40.12 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.797816  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00673258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  34.63 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  36.42 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12510  dipeptide ABC transporter, inner membrane permease component  39.4 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0113626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>