More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0628 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0628  fumarate hydratase  100 
 
 		 465 aa  947    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390858  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2041  fumarate hydratase  74.73 
 
 		 477 aa  673    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  66.74 
 
 		 465 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15861  fumarate lyase  62.07 
 
 		 466 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0997  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 464 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18661  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 464 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16681  fumarate hydratase  54.08 
 
 		 461 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120243  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1559  fumarate hydratase  54.53 
 
 		 461 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16461  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16561  fumarate hydratase  53.98 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  56.64 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  53.88 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  59.22 
 
 		 471 aa  511  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  55.53 
 
 		 469 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  53.91 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  53.91 
 
 		 513 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  54.84 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  56.3 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  53.8 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  52.81 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  55.56 
 
 		 464 aa  500  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  56.3 
 
 		 463 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  54.07 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  53.58 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  54.73 
 
 		 461 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  54.07 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  54.23 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  54.29 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  53.28 
 
 		 472 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  56.92 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 459 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  53.41 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  53.38 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 468 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  55 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  53.28 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  55 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  54.51 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  53.38 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1755  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 464 aa  487  1e-136  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  53.19 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  52.97 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  54.03 
 
 		 468 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  53.39 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  52.9 
 
 		 465 aa  488  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  54.35 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  54.19 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  53.63 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  52.95 
 
 		 467 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  53.36 
 
 		 474 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 631 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  51.74 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  53.15 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  55.26 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  54.29 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3959  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283136  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  51.3 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1346  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  55.26 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  53.59 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1362  fumarate hydratase  55.24 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0428529  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  53.04 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  52.86 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  52.81 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  52.86 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  56.03 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  53.91 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 462 aa  478  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  52.86 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  50.88 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  51.63 
 
 		 466 aa  478  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0149  fumarate hydratase  54.51 
 
 		 460 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  52.64 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  51.83 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  54.29 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  53.41 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  54.47 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  54.07 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  52.64 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>