More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1362 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1755  fumarate hydratase  97.84 
 
 		 464 aa  887    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  87.93 
 
 		 464 aa  821    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  83.62 
 
 		 464 aa  759    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3959  fumarate hydratase  97.2 
 
 		 464 aa  880    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283136  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  87.07 
 
 		 464 aa  816    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4093  fumarate hydratase  90.3 
 
 		 464 aa  823    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1362  fumarate hydratase  100 
 
 		 464 aa  946    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0428529  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  82.86 
 
 		 464 aa  748    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  83.62 
 
 		 464 aa  758    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0149  fumarate hydratase  80.35 
 
 		 460 aa  744    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1689  fumarate hydratase  86.12 
 
 		 464 aa  775    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.21128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1346  fumarate hydratase  97.63 
 
 		 464 aa  884    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  62.14 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  60.83 
 
 		 461 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  60.26 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 461 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 461 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  60.48 
 
 		 464 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  60.57 
 
 		 472 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  60.57 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  61.14 
 
 		 470 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  59.74 
 
 		 463 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  60.18 
 
 		 461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  61.14 
 
 		 462 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 467 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 463 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  60.53 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  59.3 
 
 		 465 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  60.53 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  59.52 
 
 		 465 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  60.53 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  59.08 
 
 		 465 aa  558  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  59.74 
 
 		 465 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 465 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  62.14 
 
 		 463 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  59.08 
 
 		 465 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  60.61 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  61.62 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  60.53 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  60.75 
 
 		 631 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  60.53 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  58.39 
 
 		 465 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  58.66 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  58.66 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 463 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  60.53 
 
 		 464 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  58.87 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  58.64 
 
 		 465 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  58.87 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  58.87 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 467 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 462 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 464 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 467 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  59.87 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  59.91 
 
 		 472 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  58.48 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  58.44 
 
 		 465 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  57.52 
 
 		 466 aa  548  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  59.21 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  58.17 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  58.17 
 
 		 462 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  59.91 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  58.82 
 
 		 469 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  59.26 
 
 		 468 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  58.33 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  58.04 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  59.69 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  59.65 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  56.77 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  56.74 
 
 		 461 aa  539  9.999999999999999e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  58.64 
 
 		 466 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  58.75 
 
 		 467 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  56.21 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  61.3 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  56.64 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  58.33 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  56.46 
 
 		 459 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  57.46 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  56.46 
 
 		 459 aa  537  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2715  fumarate hydratase  61.44 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  57.3 
 
 		 465 aa  538  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  57.3 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  58.77 
 
 		 464 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  55.75 
 
 		 464 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 458 aa  531  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  55.31 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>