More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15861 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0997  fumarate hydratase  66.52 
 
 		 464 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15861  fumarate lyase  100 
 
 		 466 aa  960    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18661  fumarate hydratase  66.08 
 
 		 464 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  67.46 
 
 		 465 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0628  fumarate hydratase  62.07 
 
 		 465 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390858  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16681  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 461 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120243  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1559  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 461 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16461  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 461 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16561  fumarate hydratase  59.43 
 
 		 461 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2041  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 477 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  55.51 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  56.19 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  54.29 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  55.46 
 
 		 464 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  55.24 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  55.56 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  54.35 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  53.71 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  54.65 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  54.65 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 513 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  53.8 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  54.01 
 
 		 463 aa  501  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 459 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  53.04 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  55.58 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  53.03 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  52.28 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  51.29 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 467 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  52.21 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.39 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  52.51 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 467 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 467 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 470 aa  488  1e-136  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  52.39 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  53.19 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  53.1 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 631 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  52.21 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  50.33 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 463 aa  481  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  51.99 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 463 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  54.45 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  51.41 
 
 		 469 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  52.21 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 478 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  53.39 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  54.07 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  51.92 
 
 		 544 aa  478  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 482 aa  480  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 466 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  51.84 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  51.18 
 
 		 467 aa  478  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 485 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 461 aa  481  1e-134  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  53.06 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  50.11 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  52.93 
 
 		 492 aa  478  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  53.85 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  51.85 
 
 		 468 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  51.85 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  52.52 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  52.3 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  51.43 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  50.54 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>