More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0997 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_15861  fumarate lyase  66.52 
 
 		 466 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0997  fumarate hydratase  100 
 
 		 464 aa  951    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18661  fumarate hydratase  97.41 
 
 		 464 aa  928    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  60.43 
 
 		 465 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16681  fumarate hydratase  57.92 
 
 		 461 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120243  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0628  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 465 aa  561  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390858  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1559  fumarate hydratase  57.7 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16561  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 461 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16461  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 461 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2041  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 477 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  53.15 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  52.81 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 469 aa  514  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 459 aa  505  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  53.61 
 
 		 459 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 463 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  51.32 
 
 		 513 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 513 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 468 aa  501  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  52.53 
 
 		 464 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  52.31 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  51.42 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 465 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 464 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 467 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 462 aa  485  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  51.43 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4665  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0614895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  49.56 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  49.03 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53220  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492085  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  49.02 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  48.58 
 
 		 461 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  51.32 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  49.78 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  48.7 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  51.85 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  48.91 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 478 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  48.58 
 
 		 461 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  48.81 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  48.81 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  48.81 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  48.91 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  50 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  49.34 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  47.72 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  49.34 
 
 		 457 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0425  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 498 aa  472  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  50.98 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 471 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  50 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  50.33 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  48.6 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  48.6 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  48.48 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  48.03 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  47.95 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  47.37 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  48.36 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  49.14 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  48.38 
 
 		 464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>