More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2970 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  68.68 
 
 		 513 aa  687    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  100 
 
 		 468 aa  977    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  68.68 
 
 		 513 aa  688    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  64.25 
 
 		 463 aa  611  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  57.73 
 
 		 468 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 469 aa  580  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  56.62 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  56.59 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  55.24 
 
 		 462 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  56.59 
 
 		 464 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  55.43 
 
 		 464 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  55.22 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15861  fumarate lyase  55.51 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  54.7 
 
 		 459 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  55.53 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  54.7 
 
 		 459 aa  535  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  55.1 
 
 		 465 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  58.57 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  55.24 
 
 		 467 aa  531  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 467 aa  527  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0997  fumarate hydratase  53.15 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  56.03 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  55.26 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  55.26 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  54.23 
 
 		 464 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  54.45 
 
 		 464 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  54.66 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 631 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  54.66 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  54.66 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  54.66 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1618  fumarate hydratase  52.6 
 
 		 485 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  53.46 
 
 		 464 aa  521  1e-146  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  55.04 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18661  fumarate hydratase  52.93 
 
 		 464 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  54.61 
 
 		 485 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  55.27 
 
 		 544 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  53.93 
 
 		 464 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 461 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  54.03 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  54.53 
 
 		 466 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  55.99 
 
 		 467 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  55.92 
 
 		 464 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 464 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  55.43 
 
 		 492 aa  508  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  52.39 
 
 		 463 aa  511  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  54.66 
 
 		 466 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  52.28 
 
 		 482 aa  510  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0285  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  52.39 
 
 		 463 aa  510  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  54.45 
 
 		 463 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  52.7 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  55.48 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0425  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 498 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  55.77 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  54.68 
 
 		 462 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  52.8 
 
 		 465 aa  508  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  54.27 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.85 
 
 		 463 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 470 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  55.77 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  53.04 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  54.59 
 
 		 463 aa  508  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 461 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 464 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  53.26 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  53.02 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  53.07 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  53.58 
 
 		 463 aa  501  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  53.81 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  53.28 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0628  fumarate hydratase  53.88 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390858  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2041  fumarate hydratase  54.86 
 
 		 477 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 478 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 465 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 465 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  54.17 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>