More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1618 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1618  fumarate hydratase  100 
 
 		 485 aa  1000    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  63.41 
 
 		 485 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0425  fumarate hydratase  61.36 
 
 		 498 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4865  fumarate hydratase  62.11 
 
 		 485 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  60.59 
 
 		 482 aa  594  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7115  fumarate hydratase, class II  57.98 
 
 		 487 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 469 aa  531  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  52.6 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  53.16 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  54.8 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1440  fumarate lyase  54.32 
 
 		 482 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  54.25 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  54.03 
 
 		 464 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  52.8 
 
 		 487 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  54.37 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  51.54 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  51.51 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  53.04 
 
 		 462 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  51.54 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  51.83 
 
 		 482 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  52.51 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  54.15 
 
 		 466 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  50.96 
 
 		 513 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  50.82 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  54.47 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  52.16 
 
 		 544 aa  484  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.19 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  50.74 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.19 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  53.71 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  53.39 
 
 		 631 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  51.08 
 
 		 463 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  51.95 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  53.06 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  52.4 
 
 		 466 aa  478  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2328  fumarate hydratase  52.95 
 
 		 479 aa  478  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  52.71 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  51.31 
 
 		 462 aa  478  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.51 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  53.51 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.51 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.51 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  52.07 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.51 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 463 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.51 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  52.28 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  52.72 
 
 		 469 aa  471  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  51.74 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 464 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  52.85 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 461 aa  472  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  52.97 
 
 		 456 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  51.74 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  51.08 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  52.19 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  51.84 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 470 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  53.66 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  50.88 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 463 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 474 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  52.85 
 
 		 464 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  51.95 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  52.63 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0537  fumarate hydratase, class II  54.11 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  50.54 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0542  fumarate hydratase, class II  54.34 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  50.76 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  52.19 
 
 		 464 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 466 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  51.32 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  53.29 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>