More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2328 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  84.35 
 
 		 463 aa  779    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  75.82 
 
 		 465 aa  713    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  81.88 
 
 		 467 aa  754    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2328  fumarate hydratase  100 
 
 		 479 aa  989    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  63.23 
 
 		 471 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 459 aa  608  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  62.14 
 
 		 459 aa  606  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  61.52 
 
 		 464 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  61.52 
 
 		 463 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  60.65 
 
 		 462 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  60.73 
 
 		 467 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  61.01 
 
 		 464 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  61.01 
 
 		 464 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  60.52 
 
 		 467 aa  580  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  60.39 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 464 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 631 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  61 
 
 		 472 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  61.22 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  61.26 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  60.78 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  59.87 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  61.14 
 
 		 462 aa  566  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  59.57 
 
 		 464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  57.26 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  60.95 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  62.31 
 
 		 472 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  58.57 
 
 		 465 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  58.23 
 
 		 466 aa  558  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  59.39 
 
 		 463 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  60.3 
 
 		 464 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 464 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  60.74 
 
 		 464 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 464 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 464 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  60.04 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 462 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  59.48 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  59.03 
 
 		 510 aa  558  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 462 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  58.35 
 
 		 465 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  59.27 
 
 		 465 aa  558  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  59.39 
 
 		 461 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 462 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 462 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  57.64 
 
 		 463 aa  554  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  58.48 
 
 		 466 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  59 
 
 		 470 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 462 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  58.39 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  57.7 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  61.04 
 
 		 469 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  58.61 
 
 		 462 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  59.17 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  59.16 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  57.92 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  58.82 
 
 		 462 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  59.17 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  60.82 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  57.61 
 
 		 464 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  58.39 
 
 		 462 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1387  fumarate hydratase  56.64 
 
 		 461 aa  545  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.987993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  59.16 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  57.48 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  56.83 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  56.96 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  56.83 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  56.83 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  59.16 
 
 		 478 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  57.7 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  58.04 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  56.96 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0965  fumarate hydratase, class II  58.66 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  57.92 
 
 		 464 aa  545  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  61.22 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  61.35 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  58.57 
 
 		 462 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  57.73 
 
 		 462 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  57.64 
 
 		 492 aa  541  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  57.05 
 
 		 465 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  61 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  57.86 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 464 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  57.92 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  57.7 
 
 		 465 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>