More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0425 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4865  fumarate hydratase  70.82 
 
 		 485 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0425  fumarate hydratase  100 
 
 		 498 aa  1028    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  65.54 
 
 		 485 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1618  fumarate hydratase  61.36 
 
 		 485 aa  618  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7115  fumarate hydratase, class II  62.79 
 
 		 487 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  61.83 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1440  fumarate lyase  62.85 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  59.09 
 
 		 471 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 464 aa  559  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 463 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  57.68 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  58.17 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  58.17 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  59.17 
 
 		 466 aa  552  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  58.02 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  57.8 
 
 		 464 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  56.26 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  57.58 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  56.22 
 
 		 513 aa  534  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  56.01 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  58.04 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  56.96 
 
 		 464 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 461 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  56.92 
 
 		 487 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  56.24 
 
 		 465 aa  525  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  56.46 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  56.46 
 
 		 474 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1627  fumarate hydratase class II  57.2 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  55.8 
 
 		 461 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 468 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  56.36 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  55.8 
 
 		 461 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0795  fumarate hydratase, class II  57.17 
 
 		 476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  55.9 
 
 		 510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  57.86 
 
 		 467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  56.36 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  56.43 
 
 		 463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  56.43 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  56.58 
 
 		 463 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  55.14 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  55.41 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  54.39 
 
 		 462 aa  511  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  55.53 
 
 		 470 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  55.58 
 
 		 463 aa  512  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 463 aa  509  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  53.49 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  53.93 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  55.24 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  54.59 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  53.93 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0516  fumarate hydratase, class II  55.99 
 
 		 467 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  53.49 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  55.08 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  55.79 
 
 		 466 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  55.92 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  52.7 
 
 		 463 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0537  fumarate hydratase, class II  55.77 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  54.49 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  54.37 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  53.71 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  54.49 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0542  fumarate hydratase, class II  56.21 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  56.36 
 
 		 465 aa  508  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 462 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0598  fumarate hydratase, class II  55.99 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  55.26 
 
 		 472 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3801  fumarate hydratase, class II  56.21 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  54.49 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 631 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  55.87 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  55.7 
 
 		 469 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  55.65 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  55.87 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  56.09 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  54.57 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  55.65 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0160  fumarate hydratase, class II  56.09 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  56.09 
 
 		 462 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  55.92 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 467 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  55.87 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  54.47 
 
 		 464 aa  503  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>