More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2041 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0628  fumarate hydratase  74.73 
 
 		 465 aa  699    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390858  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2041  fumarate hydratase  100 
 
 		 477 aa  969    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  62.77 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0997  fumarate hydratase  59.35 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15861  fumarate lyase  59.35 
 
 		 466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18661  fumarate hydratase  58.91 
 
 		 464 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  54.86 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16461  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1559  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 461 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16561  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 461 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16681  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 461 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120243  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  54.51 
 
 		 463 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 513 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  55 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  53.63 
 
 		 461 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  53.63 
 
 		 461 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  56.18 
 
 		 471 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 467 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  54.51 
 
 		 474 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  53.41 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  53.41 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  52.18 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  54.47 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  52.93 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  51.97 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 631 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  54.07 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  53.35 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  53.41 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  52.94 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  51.75 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  55.26 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  55.26 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  52.75 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  53.41 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  55.02 
 
 		 487 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  50.43 
 
 		 470 aa  475  1e-133  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 459 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 462 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  54.8 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50.76 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  52.75 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  52.97 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 467 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 467 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  49.67 
 
 		 464 aa  471  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  55.16 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  52.75 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 467 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  51.09 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  51.51 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>