More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_16461 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1559  fumarate hydratase  82.65 
 
 		 461 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16681  fumarate hydratase  82.86 
 
 		 461 aa  801    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120243  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16561  fumarate hydratase  82.21 
 
 		 461 aa  797    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16461  fumarate hydratase  100 
 
 		 461 aa  937    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15861  fumarate lyase  58.55 
 
 		 466 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  55.22 
 
 		 465 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0997  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18661  fumarate hydratase  57.05 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0628  fumarate hydratase  53.7 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390858  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  51.42 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  51.32 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2041  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 469 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  48.9 
 
 		 461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  48.04 
 
 		 466 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  50.66 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  50.54 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  47.82 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  48.68 
 
 		 470 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  50 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 461 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  50 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  49.01 
 
 		 468 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0420  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.425613  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1387  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.987993  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  48.46 
 
 		 478 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  48.68 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  48.58 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  50.22 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  48.8 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  48.16 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  49.12 
 
 		 465 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34880  fumarate hydratase  48.68 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0056  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0409866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  48.16 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0093  fumarate lyase  49.56 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0337943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  46.71 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  46.3 
 
 		 468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  48.8 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  48.06 
 
 		 466 aa  448  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 465 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  46.62 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  46.71 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  46.41 
 
 		 469 aa  448  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  48.8 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 465 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 462 aa  448  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  48.46 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  48.68 
 
 		 462 aa  448  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  46.93 
 
 		 461 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  49.12 
 
 		 467 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  47.03 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  48.48 
 
 		 466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  49.13 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  49.89 
 
 		 467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  48.46 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  48.14 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  47.15 
 
 		 467 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  48.9 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  47.15 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  47.15 
 
 		 467 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  45.87 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  47.15 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 465 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  46.42 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  46.93 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  46.27 
 
 		 472 aa  441  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  48.46 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  47.15 
 
 		 467 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  48.48 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  48.46 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  48.8 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  46.85 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1362  fumarate hydratase  48.8 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0428529  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1346  fumarate hydratase  48.58 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  46.64 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  46.49 
 
 		 474 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  46.85 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  48.46 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  47.92 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  46.85 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>