218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3509 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3509  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
146 aa  310  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3339  thioesterase superfamily protein  84.72 
 
 
148 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2780  thioesterase superfamily protein  76.98 
 
 
146 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3008  thioesterase superfamily protein  72.92 
 
 
158 aa  239  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3195  thioesterase superfamily protein  78.68 
 
 
143 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3189  thioesterase superfamily protein  76.26 
 
 
143 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3333  thioesterase superfamily protein  76.26 
 
 
143 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2799  thioesterase superfamily protein  76.64 
 
 
141 aa  234  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1178  thioesterase superfamily protein  76.64 
 
 
143 aa  233  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1051  thioesterase superfamily protein  76.47 
 
 
143 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1256  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  77.1 
 
 
137 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1139  thioesterase superfamily protein  77.1 
 
 
137 aa  225  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1071  thioesterase superfamily protein  77.1 
 
 
137 aa  225  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1067  thioesterase superfamily protein  76.34 
 
 
137 aa  224  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1025  thioesterase superfamily protein  80.77 
 
 
143 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2157  thioesterase family protein  65.89 
 
 
133 aa  195  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.938479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1007  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  66.14 
 
 
140 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1483  thioesterase superfamily protein  58.14 
 
 
133 aa  178  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  33.08 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2118  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.12 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296225  normal  0.477442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.78 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  32.33 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.33 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.48 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.45 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.79 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.96 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.58 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4044  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.79 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  31.58 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.61 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  26.77 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  26.9 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.85 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.08 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.66 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.85 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.6 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.48 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  26.9 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  26.9 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.85 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  26.9 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  26.9 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.2 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  26.9 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.78 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.78 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  26.9 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.14 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.81 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.08 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.16 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000193862  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.08 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2535  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.16 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000842763  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  31.16 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.16 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  30.09 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2542  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.12 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000475401  hitchhiker  0.00000263931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  44.78 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4268  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 
163 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1293  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.93 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2568  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0557  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  36.26 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.97 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.76 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1458  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0173247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  33.66 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.66 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  29.32 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.86 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2735  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.37 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234099  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1924  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.42 
 
 
191 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.66 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.2 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.73 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0562  thioesterase family protein  31.3 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0128363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3520  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.61 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>