More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4060 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  96.84 
 
 		 443 aa  888    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  77.65 
 
 		 438 aa  727    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 		 443 aa  911    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.6 
 
 		 431 aa  631  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  67.98 
 
 		 424 aa  630  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.95 
 
 		 442 aa  618  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.19 
 
 		 443 aa  604  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.66 
 
 		 447 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.87 
 
 		 439 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.78 
 
 		 438 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.59 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.47 
 
 		 441 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.77 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  66.04 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.75 
 
 		 706 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.54 
 
 		 433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  66.59 
 
 		 428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  66.11 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.51 
 
 		 440 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.44 
 
 		 448 aa  561  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  64.56 
 
 		 449 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.07 
 
 		 438 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.07 
 
 		 438 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.07 
 
 		 438 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.99 
 
 		 448 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3173  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.81 
 
 		 446 aa  551  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.43 
 
 		 438 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.92 
 
 		 441 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  63.53 
 
 		 444 aa  532  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  59.62 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.77 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.9 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.22 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.64 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.51 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.16 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.14 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.91 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.49 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.82 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.06 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.82 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  48.61 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.82 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.25 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  50.62 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  46.87 
 
 		 545 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  46.23 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  46.23 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  46.87 
 
 		 545 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  47.58 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.3 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.62 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.4 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.58 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.56 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.72 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.67 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.03 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  48.66 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.56 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.44 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.53 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  49.37 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.82 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  48.11 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  47.56 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.56 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.87 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  43.42 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.82 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  43.42 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  47.86 
 
 		 449 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1168  NADH dehydrogenase (quinone)  43.63 
 
 		 538 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.073062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  47.77 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.14 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.85 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  48.87 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  47.49 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.83 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.83 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  48.49 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  47.99 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  48.61 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  43.02 
 
 		 602 aa  378  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.34 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.78 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  46.97 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.83 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.71 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  47.18 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  49.74 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  46.34 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.34 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  47.74 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.34 
 
 		 436 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  47.74 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.848425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>