More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1880 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  82.15 
 
 
445 aa  744    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.56 
 
 
433 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  73.3 
 
 
428 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.91 
 
 
706 aa  691    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3173  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.72 
 
 
446 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  72.98 
 
 
428 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  94.55 
 
 
438 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.73 
 
 
439 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  75.93 
 
 
441 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.32 
 
 
438 aa  787    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.55 
 
 
438 aa  788    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.94 
 
 
434 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  89.32 
 
 
438 aa  787    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
441 aa  902    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.36 
 
 
438 aa  627  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.43 
 
 
448 aa  629  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.32 
 
 
440 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.32 
 
 
448 aa  608  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  71.15 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.73 
 
 
443 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  69.51 
 
 
424 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.88 
 
 
431 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.6 
 
 
442 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.29 
 
 
444 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.57 
 
 
439 aa  595  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69.38 
 
 
447 aa  594  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.92 
 
 
443 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.16 
 
 
443 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.48 
 
 
439 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  62.74 
 
 
438 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.47 
 
 
421 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.9 
 
 
434 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  52.44 
 
 
432 aa  435  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.23 
 
 
422 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.32 
 
 
426 aa  435  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.99 
 
 
427 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.99 
 
 
427 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.23 
 
 
446 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.01 
 
 
446 aa  429  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.83 
 
 
451 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.82 
 
 
426 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.47 
 
 
424 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.83 
 
 
427 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.59 
 
 
449 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  51.11 
 
 
428 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  51.59 
 
 
430 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.97 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  50.24 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.84 
 
 
454 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.74 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.29 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.75 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.61 
 
 
429 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.29 
 
 
441 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.29 
 
 
441 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.48 
 
 
456 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  51.18 
 
 
438 aa  411  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1498  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.52 
 
 
458 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.275368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
467 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  50.62 
 
 
429 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1311  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.33 
 
 
439 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  50.5 
 
 
431 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.93 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.85 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  53.14 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.76 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  50.37 
 
 
434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.85 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  49.5 
 
 
433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.74 
 
 
427 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  48.92 
 
 
425 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  48.92 
 
 
425 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  49.38 
 
 
434 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  48.68 
 
 
450 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  50.37 
 
 
434 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1560  NADH dehydrogenase I subunit F  51.36 
 
 
429 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  49.63 
 
 
441 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  48.83 
 
 
448 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.18 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.62 
 
 
452 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  48.18 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  48.69 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.76 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  48.43 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.38 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
431 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5103  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.6 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  47.78 
 
 
493 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  48.18 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4395  NADH dehydrogenase I subunit F  50.61 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>