187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0975 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0975  NQR2 and RnfD family protein  100 
 
 
362 aa  728    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0305  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.82 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14340  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.08 
 
 
307 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000923733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2431  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.44 
 
 
321 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000125331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0080  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.75 
 
 
335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0300271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0611  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.94 
 
 
326 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.798046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1572  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  36.42 
 
 
318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.732649  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0987  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.81 
 
 
324 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.379961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1326  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.54 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000145207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1664  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.46 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0262  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfD subunit-like  33.02 
 
 
334 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0343  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.58 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0703  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.6 
 
 
318 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0679  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.6 
 
 
318 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1311  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.58 
 
 
330 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1530  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.65 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0274515  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0687  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.95 
 
 
355 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0388  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.79 
 
 
325 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.91 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476973  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2698  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.52 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0784392  normal  0.0118792 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0212  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.97 
 
 
336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0013917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2594  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.56 
 
 
330 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0698  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.31 
 
 
327 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.936145  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2821  electron transport complex, D subunit  28.57 
 
 
359 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1734  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.14 
 
 
361 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1092  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.16 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0837  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, B subunit  32.89 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0064  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.16 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1156  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.33 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1082  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.06 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0652  NQR2 and RnfD family protein  31.72 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.114634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2896  electron transport complex, D subunit  27.06 
 
 
343 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2968  electron transport complex protein RnfD  28.57 
 
 
357 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.84 
 
 
308 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00551024  hitchhiker  0.00264587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0307  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  26.23 
 
 
337 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0928728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2629  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.65 
 
 
352 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1819  electron transport complex protein RnfD  27.92 
 
 
352 aa  105  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3235  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.38 
 
 
338 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.467841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1401  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.45 
 
 
343 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1569  electron transport complex protein RnfD  27.35 
 
 
352 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.08013  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1838  electron transport complex protein RnfD  27.35 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00396997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2342  electron transport complex protein RnfD  27.35 
 
 
352 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0357526  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0062  NQR2 and RnfD family protein  29.76 
 
 
302 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01600  electron transport complex protein RnfD  27.35 
 
 
352 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01590  hypothetical protein  27.35 
 
 
352 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0216636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0935  electron transport complex protein RnfD  26.84 
 
 
350 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.495036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2011  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.35 
 
 
352 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1706  electron transport complex protein RnfD  27.35 
 
 
352 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1999  electron transport complex protein RnfD  27.07 
 
 
352 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00297126  normal  0.240124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0735  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  25.77 
 
 
350 aa  99.4  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.170289  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2237  electron transport complex protein RnfD  25.29 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000430242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0540  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.81 
 
 
325 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0286  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.43 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1062  electron transport complex protein RnfD  23.97 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1793  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.74 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573708 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19240  Electron transport complex, subunit D  25.95 
 
 
343 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1033  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  26.39 
 
 
343 aa  96.7  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000831458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2403  electron transport complex protein RnfD  28.65 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.469732  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2109  electron transport complex protein RnfD  24.41 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4548  electron transport complex protein RnfD  24.78 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2262  electron transport complex protein RnfD  24.78 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2062  electron transport complex protein RnfD  24.41 
 
 
349 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000244661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02732  electron transport complex protein RnfD  26.73 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1626  electron transport complex protein RnfD  25 
 
 
352 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  0.410442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1566  electron transport complex protein RnfD  25 
 
 
352 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.094034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1718  electron transport complex protein RnfD  25 
 
 
352 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1554  electron transport complex protein RnfD  25 
 
 
352 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.52008  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2322  electron transport complex protein RnfD  23.21 
 
 
351 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2276  electron transport complex protein RnfD  24.12 
 
 
349 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.034866  normal  0.800478 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1692  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  27.8 
 
 
412 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.269427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2157  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  24.14 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.853366  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1886  electron transport complex protein RnfD  24.72 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115078  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2511  electron transport complex protein RnfD  25.07 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0950  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  28.89 
 
 
414 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1784  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  25.22 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  27.14 
 
 
366 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2250  electron transport complex protein RnfD  26.72 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000198545  normal  0.637976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3304  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  29.01 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1818  electron transport complex protein RnfD  26 
 
 
350 aa  91.3  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452065  decreased coverage  0.000391515 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3316  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  29.01 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000279294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1847  electron transport complex protein RnfD  24.12 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000941791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1883  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  28.57 
 
 
415 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1712  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  27.3 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361106  normal  0.0886494 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2022  electron transport complex protein RnfD  23.21 
 
 
351 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  29.01 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.400587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1866  electron transport complex protein RnfD  25.79 
 
 
350 aa  90.1  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2010  electron transport complex protein RnfD  26.72 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.079391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1898  electron transport complex protein RnfD  26.72 
 
 
351 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000890803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2175  electron transport complex protein RnfD  24.35 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.164146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1172  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  26.16 
 
 
345 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0040  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  24.73 
 
 
409 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1542  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  26.49 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.142338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2388  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  27.76 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.883965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1160  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  25.73 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06712  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  28.3 
 
 
450 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3195  RnfD protein  29.15 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2171  electron transport complex protein RnfD  25.07 
 
 
349 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0839879  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2067  electron transport complex protein RnfD  25.07 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0541155  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1908  electron transport complex protein RnfD  25.07 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1798  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  28.97 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.726384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>