More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0966 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0966  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
367 aa  746    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.611254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0200  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.22 
 
 
369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0696439 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1202  GMP synthase domain-containing protein  46.84 
 
 
377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.848628  hitchhiker  0.00267313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  40.98 
 
 
302 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  39.52 
 
 
310 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  39.52 
 
 
310 aa  248  8e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  40 
 
 
305 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  38.98 
 
 
310 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  39.52 
 
 
310 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  39.95 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  39.25 
 
 
310 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  39.62 
 
 
312 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  39.52 
 
 
305 aa  237  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  38.75 
 
 
305 aa  235  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  41.33 
 
 
304 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  39.3 
 
 
305 aa  233  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  39.24 
 
 
305 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  38.75 
 
 
305 aa  230  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  38.98 
 
 
512 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  39.01 
 
 
517 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  37.4 
 
 
305 aa  223  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  37.9 
 
 
510 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  38.15 
 
 
505 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  34.67 
 
 
512 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  37.67 
 
 
305 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  36.22 
 
 
501 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  36.22 
 
 
501 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.22 
 
 
510 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  36.41 
 
 
512 aa  219  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  38.07 
 
 
508 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  35.03 
 
 
507 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  34.4 
 
 
512 aa  216  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  37.5 
 
 
510 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  36.31 
 
 
507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  35.87 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2718  GMP synthase, large subunit  37.67 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0442  GMP synthase  36.11 
 
 
512 aa  212  7e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  37.8 
 
 
515 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  37.8 
 
 
515 aa  212  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  37.8 
 
 
512 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  37.8 
 
 
512 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  35.11 
 
 
537 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  37.8 
 
 
512 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  37.37 
 
 
515 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  36.14 
 
 
517 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  37.8 
 
 
515 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  37.27 
 
 
511 aa  212  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  35.09 
 
 
513 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  34.57 
 
 
516 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  34.15 
 
 
505 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  37.27 
 
 
512 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  37.14 
 
 
512 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  37.23 
 
 
512 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  37.53 
 
 
512 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  35.11 
 
 
531 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  35.56 
 
 
509 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  34.93 
 
 
506 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  34.3 
 
 
522 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  35.39 
 
 
513 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  34.78 
 
 
507 aa  209  5e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  36.83 
 
 
510 aa  209  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  35.68 
 
 
508 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  33.95 
 
 
525 aa  209  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  35.05 
 
 
505 aa  209  8e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  34.83 
 
 
512 aa  208  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  35.77 
 
 
513 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  34.92 
 
 
520 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  34.96 
 
 
516 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  35.73 
 
 
524 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  35.66 
 
 
511 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  33.42 
 
 
511 aa  206  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0910  GMP synthase, large subunit  35.17 
 
 
519 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  35.46 
 
 
524 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  33.78 
 
 
513 aa  206  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  35.12 
 
 
511 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  35.01 
 
 
526 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  35.58 
 
 
511 aa  206  7e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  33.6 
 
 
517 aa  206  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  35.31 
 
 
517 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  32.73 
 
 
528 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  33.51 
 
 
519 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  33.42 
 
 
513 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  34.12 
 
 
520 aa  205  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  33.51 
 
 
519 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  36.39 
 
 
516 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  33.51 
 
 
519 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  34.49 
 
 
539 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  33.96 
 
 
525 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  35.12 
 
 
509 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  34.5 
 
 
517 aa  203  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  34.14 
 
 
509 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  35.12 
 
 
509 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  34.5 
 
 
517 aa  203  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  34.85 
 
 
520 aa  203  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  34.32 
 
 
518 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  35.85 
 
 
516 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  34.38 
 
 
524 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  33.33 
 
 
517 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  34.21 
 
 
534 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  33.51 
 
 
533 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>