More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0200 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0200  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 		 369 aa  748    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0696439 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0966  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.22 
 
 		 367 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.611254  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1202  GMP synthase domain-containing protein  48.68 
 
 		 377 aa  347  1e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.848628  hitchhiker  0.00267313 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  40.16 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  39.89 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  40.32 
 
 		 305 aa  245  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  39.63 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  40.48 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  39.08 
 
 		 305 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  40.43 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  38.71 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  40.36 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  39.36 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  39.36 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  38.01 
 
 		 305 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  39.41 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  38.67 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  38.34 
 
 		 305 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  37.37 
 
 		 305 aa  225  8e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  37.97 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2546  GMP synthase  38.1 
 
 		 547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1292  GMP synthase  38.1 
 
 		 539 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1522  GMP synthase  38.1 
 
 		 539 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.403543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2402  GMP synthase  38.1 
 
 		 539 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.630699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3290  GMP synthase  38.1 
 
 		 539 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0624455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2454  GMP synthase  38.1 
 
 		 539 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2021  GMP synthase  38.1 
 
 		 539 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2058  GMP synthase  37.83 
 
 		 599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  37.3 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2718  GMP synthase, large subunit  38.61 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  37.2 
 
 		 507 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1431  GMP synthase  37.57 
 
 		 547 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00571837  normal  0.0960661 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  37.7 
 
 		 540 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  36.34 
 
 		 521 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  37.27 
 
 		 538 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  37.34 
 
 		 541 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  36.6 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  36.51 
 
 		 507 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  35.64 
 
 		 506 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  37.01 
 
 		 538 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  37.01 
 
 		 526 aa  212  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1372  GMP synthase  36.24 
 
 		 539 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588127  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  35.96 
 
 		 539 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  34.66 
 
 		 514 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  34.66 
 
 		 514 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1463  GMP synthase  36.51 
 
 		 539 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160024  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  36.83 
 
 		 501 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  35.9 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1854  GMP synthase  36.51 
 
 		 539 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  35.79 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  36.83 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  36.13 
 
 		 512 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  36.97 
 
 		 512 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1308  GMP synthase  35.98 
 
 		 539 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00743911  normal  0.913177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1622  GMP synthase  36.39 
 
 		 534 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661733  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2764  GMP synthase  37.01 
 
 		 539 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  34.84 
 
 		 525 aa  209  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  37.47 
 
 		 513 aa  209  6e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  35.9 
 
 		 510 aa  209  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  36.68 
 
 		 547 aa  209  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  35.7 
 
 		 528 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  36.75 
 
 		 523 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  35.17 
 
 		 512 aa  208  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  35.34 
 
 		 512 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  35.75 
 
 		 517 aa  208  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  37.16 
 
 		 519 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  37.4 
 
 		 524 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  36.7 
 
 		 510 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  35.83 
 
 		 520 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  37.06 
 
 		 520 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  35.26 
 
 		 533 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  34.82 
 
 		 540 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  35.11 
 
 		 512 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  36.62 
 
 		 529 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  36.15 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  36.34 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  36.89 
 
 		 520 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  35 
 
 		 517 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  37.67 
 
 		 516 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  36.49 
 
 		 519 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  36.78 
 
 		 520 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  35.09 
 
 		 532 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  37.84 
 
 		 510 aa  206  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  35.09 
 
 		 517 aa  205  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  35.88 
 
 		 527 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  36 
 
 		 533 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  36.1 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  36.84 
 
 		 534 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  34.95 
 
 		 520 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  35.79 
 
 		 508 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  35 
 
 		 531 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  35.34 
 
 		 518 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  36.1 
 
 		 516 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  35.25 
 
 		 535 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  36.51 
 
 		 527 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  36 
 
 		 560 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  35.58 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2009  GMP synthase  35.7 
 
 		 539 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  36.1 
 
 		 540 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  35.08 
 
 		 518 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>