More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5515 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
334 aa  668    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.486465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.34 
 
 
335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.7 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.922354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 
336 aa  299  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
307 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3310  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.1 
 
 
308 aa  215  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
312 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.84 
 
 
308 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
309 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
309 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000256929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
312 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13695  dipeptide-transport integral membrane protein ABC transporter dppB  38.14 
 
 
308 aa  202  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0848221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 
308 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11060  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.09 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.463439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12600  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.97 
 
 
304 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549208  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0487  putative dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  35.03 
 
 
308 aa  192  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.346546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013844  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0253  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  34.13 
 
 
308 aa  189  8e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8933  ABC transporter permease protein  35.63 
 
 
307 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6675  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
306 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  0.593084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
314 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3120  IM pore protein  36.14 
 
 
327 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682288  normal  0.0671441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  36.33 
 
 
298 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  31.66 
 
 
306 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
336 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00484259  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
306 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 
319 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2856  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  32.34 
 
 
326 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
305 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
331 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.308853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  33.91 
 
 
336 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  36.2 
 
 
319 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
313 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.764925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  34.49 
 
 
336 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.74 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.819891  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.844486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
304 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.692549  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.443976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.31 
 
 
319 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000244558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
304 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
313 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  33.91 
 
 
336 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
324 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
314 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
336 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.72 
 
 
336 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  33.72 
 
 
337 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
321 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
326 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
319 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.94 
 
 
313 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
313 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
335 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
308 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.72 
 
 
336 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
352 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000389159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
313 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 
306 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
305 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
326 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
306 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  32.85 
 
 
339 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
327 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
319 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6954  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  33.83 
 
 
319 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
317 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
320 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0617346  normal  0.17443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.12 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.12 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
305 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
313 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.12 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.12 
 
 
306 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
347 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  34.12 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  35.03 
 
 
336 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
319 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.12 
 
 
306 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>