More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12600  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  100 
 
 
304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549208  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  60.33 
 
 
308 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.28 
 
 
308 aa  350  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.91 
 
 
309 aa  348  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488789  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13695  dipeptide-transport integral membrane protein ABC transporter dppB  58.33 
 
 
308 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0848221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8933  ABC transporter permease protein  53.62 
 
 
307 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.58 
 
 
308 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.98 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0253  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  49.34 
 
 
308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11060  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  53.67 
 
 
309 aa  312  5.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.463439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3310  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  51.82 
 
 
308 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.31 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013844  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0487  putative dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  50 
 
 
308 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.346546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.99 
 
 
307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
309 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000256929 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.97 
 
 
312 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.65 
 
 
312 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
308 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.922354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
336 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  38.64 
 
 
313 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  37.5 
 
 
336 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
334 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
334 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
306 aa  198  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.166982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
309 aa  195  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
336 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0503  ABC transporter permease protein  34.85 
 
 
311 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
306 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 
335 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
311 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
335 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
334 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.486465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
307 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  34.45 
 
 
334 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
334 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.69 
 
 
336 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 
335 aa  192  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
334 aa  191  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
334 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
334 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  34.95 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  34.65 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  34.94 
 
 
339 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  34.94 
 
 
339 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  34.94 
 
 
339 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  34.94 
 
 
339 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  34.94 
 
 
339 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  34.94 
 
 
339 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  34.94 
 
 
339 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  34.94 
 
 
339 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
335 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  34.94 
 
 
381 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  34.64 
 
 
339 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
306 aa  188  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  34.64 
 
 
339 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  34.64 
 
 
339 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  34.64 
 
 
339 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  34.64 
 
 
339 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
335 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
336 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  34.94 
 
 
339 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
335 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
308 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  35.28 
 
 
335 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  34.53 
 
 
339 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
334 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
311 aa  186  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  33.45 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  34.23 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  32.83 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
334 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
312 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
306 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  34.85 
 
 
337 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  35.26 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  34.13 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  34.13 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
325 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
306 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
336 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  33.98 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 
336 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
339 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.11 
 
 
333 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
336 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
335 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
336 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  35.37 
 
 
336 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  34.97 
 
 
334 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>