More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0253 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0253  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  100 
 
 
308 aa  617  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0169931  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0487  putative dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  83.77 
 
 
308 aa  530  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.346546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.44 
 
 
308 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  56.82 
 
 
308 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.28 
 
 
309 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57 
 
 
308 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13695  dipeptide-transport integral membrane protein ABC transporter dppB  54.72 
 
 
308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0848221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11060  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  55.41 
 
 
309 aa  348  8e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.463439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.96 
 
 
309 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000256929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.12 
 
 
307 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 
307 aa  320  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.810626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3310  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  47.56 
 
 
308 aa  300  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12600  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  49.34 
 
 
304 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549208  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8933  ABC transporter permease protein  49.84 
 
 
307 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.49 
 
 
308 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.85 
 
 
307 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013844  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4177  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
312 aa  275  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
312 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.63 
 
 
308 aa  255  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  37.8 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
309 aa  218  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.922354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
336 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  39.14 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  39.14 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 
306 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  39.14 
 
 
306 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.14 
 
 
306 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
334 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  38.85 
 
 
313 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.34 
 
 
306 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
307 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.5 
 
 
336 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
311 aa  205  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  37.01 
 
 
306 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
306 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
306 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.01 
 
 
306 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.01 
 
 
306 aa  205  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  37.01 
 
 
306 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  37.01 
 
 
306 aa  205  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
313 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  36.01 
 
 
316 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  34.93 
 
 
337 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.39 
 
 
341 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445478  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  37.01 
 
 
306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  37.01 
 
 
306 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
311 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  33.83 
 
 
339 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  33.83 
 
 
339 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  36.69 
 
 
306 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
306 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  36.69 
 
 
306 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 
306 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
318 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  35.63 
 
 
336 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
308 aa  201  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  33.23 
 
 
339 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  36.69 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  35.63 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  32.94 
 
 
339 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  36.95 
 
 
298 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  33.53 
 
 
339 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  32.94 
 
 
339 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  32.94 
 
 
339 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  33.53 
 
 
351 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  33.23 
 
 
339 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  32.94 
 
 
339 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.35 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  34.12 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
316 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00994535  normal  0.14386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
308 aa  199  7e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  33.73 
 
 
336 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
332 aa  198  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  35.31 
 
 
335 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
306 aa  198  9e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000961636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
313 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  32.64 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  32.64 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  32.64 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.73 
 
 
333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  32.64 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  32.64 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  32.64 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  32.64 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0610  oligopeptide transporter permease  34.3 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  32.64 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  32.64 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>