40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1044 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  43.31 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  40.33 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  37.38 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  32.72 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  38.62 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  37.38 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  37.38 
 
 		 248 aa  99  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  36.89 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  43.51 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  41.56 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  33.09 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  35.61 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  30.52 
 
 		 224 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  33.57 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  28.17 
 
 		 185 aa  84.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  33.75 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  30.28 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  28.17 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  28.06 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  27.7 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  27.88 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  28.06 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  32.88 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  30.47 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  27.61 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  28.68 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  32.31 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  31.34 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  25.34 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  30.37 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  29.41 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  28.38 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  29.89 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  29.89 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  22.88 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2097  hypothetical protein  22.73 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  22.46 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  26.15 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>