39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2054 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  89.32 
 
 		 205 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  40.33 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  38.96 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  31.98 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  33.76 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  33.96 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  36.36 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  35.46 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  35.71 
 
 		 233 aa  88.6  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  31.16 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  30.64 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  34.06 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  33.55 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  33.55 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  35.19 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  35.25 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  33.55 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  33.14 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  32.16 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  31.16 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  25.93 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  29.5 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  28.68 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  30.43 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  28.97 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  29.63 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  28.37 
 
 		 165 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  30.65 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3019  hypothetical protein  28.37 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  21.31 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  22.86 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  33.06 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  30.83 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  24.81 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  33.82 
 
 		 223 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  33.82 
 
 		 225 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>