29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1646 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  87.03 
 
 		 185 aa  339  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  63.64 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  61.41 
 
 		 184 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  61.08 
 
 		 185 aa  227  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  60.22 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  53.76 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  41.95 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  31.21 
 
 		 216 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  40.71 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  29.61 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  40.71 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  40.71 
 
 		 248 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  31.88 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  27.34 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  30.72 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  31.82 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  30.65 
 
 		 205 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  38.82 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  39.24 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  32.62 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  29.5 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  28.37 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  28.37 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  26.47 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  30.12 
 
 		 315 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  24.78 
 
 		 242 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  23.39 
 
 		 177 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>