39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3130 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  59.24 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  64.36 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  59.36 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  52.72 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  61.41 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  54.3 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  44.44 
 
 		 199 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  32.16 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  35.47 
 
 		 216 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  34.16 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  44.14 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  33.57 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  39.53 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  39.53 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  32.26 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  30.43 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  48.72 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  32.14 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  47.44 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  28.22 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  27.61 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  35 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  25.73 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  29.83 
 
 		 252 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  33.77 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  32.94 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  26.4 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  29.41 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  36 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  29.67 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1102  hypothetical protein  30.95 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  0.0200778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  33.82 
 
 		 155 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  32.61 
 
 		 223 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  35.37 
 
 		 225 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>